Mycologie

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La mycologie est la science consacrée à l'étude des champignons (grec µύκης; « champignon »). Cette science, assez proche de la botanique qui étudie les plantes, englobe aussi parfois l'étude des myxomycètes, bien qu'il s'agisse d'organismes n'ayant pas la même structure que les champignons (mais autrefois classés parmi les champignons). De même les Oomycètes, maintenant classés parmi les Straménopiles, restent classiquement étudiés en "mycologie".

Sommaire

1 Histoire de la mycologie
2 Systématique des champignons
3 Classification des champignons
- 3.1 Classification génétique des champignons
4 Voir aussi

[modifier] Histoire de la mycologie

En tant que science, la mycologie remonte sans doute au Suédois Carl von Linné (1707-1778) et à son ouvrage Species Plantarum (1753), même si les champignons n'y occupent pas une place vraiment séparée du reste des plantes. Le premier ouvrage entièrement consacré aux champignons a été publié en 1801 par le Sud-africain Christiaan Hendrik Persoon (1755-1837) (Synopsis methodica fungorum), mais on retiendra surtout le travail d'un autre Suédois, Elias Magnus Fries (1794-1878), qui publie les trois volumes de son Systema Mycologicum entre 1821 et 1832 ; puis le travail de l'Italien Pier Andrea Saccardo (1845-1920) qui publia un monumental ouvrage de Classification à la fin du XIX^e siècle Sylloge fungorum hucusque cognitorum.
Le travail important des mycologues et des botanistes du XIX^e siècle aboutit au Code international de nomenclature botanique (CINB), créé à Vienne en 1905 et qui fait toujours jurisprudence. On remarquera que, même si les champignons constituent aujourd'hui un règne du vivant séparé de celui des plantes, on a continué de leur appliquer la nomenclature botanique.

Vous pouvez consulter ici une liste de mycologues.

[modifier] Systématique des champignons

La systématique est la partie des Sciences naturelles qui a pour objet de dénombrer et de définir les unes par rapport aux autres les espèces et de les organiser en groupements hiérarchisés, genres, tribus, familles, etc. Elle est encore souvent un peu sous-estimée, passant pour être la plus simple, n'ayant longtemps exigé que peu de moyens d'investigations.

Ceci est encore plus vrai pour la systématique mycologique qui se trouve privée d'un grand nombre des moyens qui ont permis aux autres branches de l'histoire naturelle de faire des progrès rapides. Les champignons étant de poussée capricieuse et éphémère, leur récolte reste soumise au hasard, nécessite de nombreuses visites infructueuses. De plus, ils exigent l'observation in vivo car beaucoup de caractères essentiels disparaissent. Enfin, très peu d'espèces peuvent être cultivées pour observer leur croissance en culture pure, ou tenter des fécondations expérimentales instructives. Il faut donc en moyenne une quinzaine d'années pour pouvoir étudier vivantes la plupart des espèces d'un genre donné.

Voir la page Classification systématique des champignons.

[modifier] Classification des champignons

La taxinomie des champignons est soumise à une hiérarchie identique à celle des plantes, les divers suffixes utilisés permettant de différencier les éléments de cette hiérarchie. Sachant que le sommet de la hiérarchie est le domaine (en l'occurrence, celui des Eucaryotes ou Eukaryota), suivi du règne (ici les Fungi ou champignons), le reste de la nomenclature se fait selon les suffixes suivants :

-mycota : division (ou embranchement);
-mycotina : subdivision (sous-embranchement);
-mycetes : classe;
-mycetideae : sous-classe;
-ales : ordre;
-ineae : sous-ordre;
-aceae : famille;
-oideae : sous-famille;
-ieae : tribu;
-inae : sous-tribu (les notions de tribu et sous-tribu sont rarement utilisées).

Suivent le genre (éventuellement divisé en sous-genres, sections, sous-sections, séries et sous-séries) et l'espèce (divisions possibles : sous-espèce, variété, sous-variété, forme, subforme, forme spéciale, race), le tout permettant de définir un individu.

Si l'ensemble des taxons est clairement défini, ce que l'on met dedans l'est beaucoup moins, d'autant que les études sur l'ADN entraînent de profonds bouleversements. À titre d'exemple, on précisera que, jusque dans les années 1990, on classait les champignons en quatre divisions, Gymnomycètes, Deutéromycètes, Mastigomycètes, Amastigomycètes. Aujourd'hui, il y a toujours quatre divisions, mais ce ne sont plus les mêmes : Chytridiomycètes, Zygomycètes, Ascomycètes, Basidiomycètes.