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Étymologiquement, le mot hypothèse vient du grec hupothesis  :

• Le préfixe hypo signifie « inférieur », « manque » par opposition au préfixe hyper. Par exemple, le terme hypoglycémie désigne une trop faible concentration de glucose dans le sang alors que le terme hyperglycémie désigne une trop forte concentration.
• le suffixe thèse désigne une « opinion », une « affirmation » et a la même racine que le mot théorie.

Miraculeusement, le sens actuel du mot hypothèse est resté assez proche de son origine étymologique : il désigne « moins » qu'une « opinion » ou une « affirmation ». Plus précisément, une hypothèse est une proposition ou une explication que l'on se contente d'énoncer sans prendre position sur sa véracité c'est-à-dire sans l'affirmer ou la nier. Une fois énoncée, on se propose de l'étudier, de travailler avec, d'adopter une attitude par rapport à elle, dans tous les sens que l'on peut donner à ces expressions :

• Dans le but de prouver qu'elle est fausse ou vraie en ayant recours à des arguments théoriques comme en philosophie s'il s'agit par exemple de l'hypothèse selon laquelle les « idées » existeraient indépendamment de l'esprit humain.

• Dans le but de prouver qu'elle est fausse ou vraie en ayant recours à des méthodes expérimentales comme dans les sciences s'il s'agit par exemple de l'hypothèse selon laquelle « l'homme », le « chimpanzé » et le « gorille » auraient un ancêtre commun dont l'origine est située quelque part en Afrique de l'est.

• Dans le but de ne pas se prononcer sur sa véracité mais d'en étudier seulement ses conséquences logiques comme en mathématiques s'il s'agit par exemple de l'hypothèse selon laquelle par un point A situé hors d'une droite (D), il n'existe qu'une seule droite (D') passant par A et parallèle à (D) (les conséquences qui en résultent font l'objet de la géométrie euclidienne) ou encore de l'hypothèse selon laquelle par un point A situé hors d'une droite (D), il existe une infinité de droites (D') passant par A et parallèles à (D) ( les conséquences qui en résultent font l'objet de la géométrie non euclidienne ).

• Dans le but de se prononcer sur sa véracité pour des raisons sentimentales ou religieuses sans chercher véritablement d'arguments ou de preuves s'il s'agit par exemple de l'hypothèse selon laquelle il existerait un « autre monde » que notre monde matériel, un « au-delà » inaccessible à nos sens et à nos instruments de mesure et d'observation.

En résumé : une hypothèse est la simple formulation d'une proposition, la personne qui l'énonce ne prenant pas position sur le fait de savoir si ce qu'elle dit est vrai ou faux. On se contente ensuite de travailler dessus, d'où l'expression hypothèse de travail, ou de prendre au contraire position sans travailler dessus pour des raisons sentimentales, religieuses ou politiques par exemple.bg:Хипотеза ca:Hipòtesi da:Hypotese de:Hypothese en:Hypothesis et:Hüpotees es:Hipótesis eo:Hipotezo he:השערה (מדע) id:Hipotesis is:Tilgáta ko:가설 mk:Хипотеза nl:Hypothese no:Hypotese pl:Hipoteza pt:Hipótese sl:Hipoteza th:สมมุติฐาน zh:假說