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Chromista (classification phylogénétique)

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Sommaire

[modifier] Introduction

Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Chromista, c'est à dire un arbre mettant en lumière les relations évolutives complexes (relations groupes ancestraux - groupes descendants) existantes entre les différents organismes vivants, ou taxa, constituant ce groupe. Du fait de ses méthodes nouvelles basées sur la biologie moléculaire, la phylogénie, science récente à l'origine de la classification phylogénétique du vivant, est en plein essort et parfois en contradiction avec l'ancienne classification classique, majoritairement basée, elle, sur des critères morphologiques et physiologiques. Aussi, certains points particuliers font parfois encore l'objet de débats au sein de la communauté scientifique. L'objectif, s'il y a lieu, est également de présenter ces derniers ici.
Cette arbre présente aussi bien les organismes encore existants aujourd'hui que les groupes éteints (incluant les groupes fossiles).


[modifier] Arbre phylogénétique résumé

└─o Chromista
  ├─? Centrohelea ou Centroheliozoa
  ├─? Telonemidae
  ├─o Cryptista
  │ └─o Cryptophyta
  │   ├─o Goniomonadales
  │   └─o Cryptomonadida
  └─o Chromobiota
    ├─o Haptophyta
    │ ├─o Pavlovophyceae
    │ └─o Prymnesiophyceae
    └─o Heterokonta ou Stramenopiles
      ├─o Slabyrinthulida ou Labyrinthulomycetes
      └─o
        ├─o Bicosoecida
        └─o
          ├─o Sloomycetes
          │ ├─o Hyphochytriomycetes ou Hyphochytriales
          │ └─o Oomycota
          └─o Stramenochromes ou Ochrophyta
            ├─o Diatomeae
            │ ├─o Bolidophyceae ou Bolidomonadales
            │ └─o Bacillariophyta
            │   ├─o Bacillariophyceae
            │   ├─o Fragilariophyceae
            │   └─o Coscinodiscophyceae
            └─o Phaeista
              ├─o Parmales
              ├─o Hypogyrista
              │ ├─o Pelagophyceae
              │ └─o Actinochrysophyceae ou Axodines
              └─o Chrysista
                ├─o Limnistia
                │ ├─o Eustigmatales
                │ ├─o Raphidomonadales
                │ ├─o Synurales
                │ ├─o Phaeothamniophyceae
                │ └─o Chrysophyceae
                └─o Phaeistia
                  ├─o Xanthophyceae
                  └─o Phaeophyceae


[modifier] Arbre phylogénétique développé

└─o Chromista
  ├─? Centrohelea ou Centroheliozoa
  │ ├─o Axoplasthelida ou Gymnosphaeridae
  │ └─o Centroplasthelida
  │   ├─o Heterophryidae
  │   ├─o Acanthocystidae
  │   └─o Raphidiophryidae
  ├─? Telonemidae
  ├─o Cryptista
  │ ├─o Kathablepharida
  │ └─o Cryptophyta
  │   ├─o Goniomonadales
  │   └─o Cryptomonadida
  │     ├─o Pyrenomonadales
  │     └─o Cryptomonadales
  │       ├─o Pleuromastigaceae
  │       ├─o Butschliellaceae
  │       ├─o Hilleaceae
  │       ├─o Hemiselmidaceae
  │       └─o Cryptomonadaceae
  └─o Chromobiota
    ├─o Haptophyta
    │ ├─o Pavlovophyceae
    │ └─o Prymnesiophyceae
    │   ├─? Heterococcolithophorida
    │   ├─? Holococcolithophorida
    │   ├─? Nannolithida
    │   │ ├─o Braarudosphaeraceae
    │   │ └─o Ceratolithaceae
    │   ├─o Zygodiscales
    │   │ ├─o Zygodiscaceae
    │   │ ├─o Pontosphaeraceae
    │   │ └─o Helicosphaeraceae
    │   ├─o Syracosphaerales
    │   │ ├─o Rhabdosphaeraceae
    │   │ ├─o Calciosoleniaceae
    │   │ └─o Syracosphaeraceae
    │   ├─o Prymnesiales
    │   ├─o Phaeocystales
    │   ├─o Isochrysidales
    │   │ ├─o Isochrysidaceae
    │   │ └─o Noelaerhabdaceae
    │   └─o Coccolithophorales
    │     ├─? Reticulosphaeridae
    │     ├─o Calcidiscaceae
    │     ├─o Coccolithaceae
    │     ├─o Hymenomonadaceae
    │     └─o Pleurochrysidaceae
    └─o Heterokonta ou Stramenopiles
      ├─? Hamatores
      │ ├─o Caecitellidae
      │ └─o Pseudodendromonadidae
      └─o
        ├─o Slopalinida
        │ ├─o Opalinidae
        │ └─o Proteromonadidae
        ├─o Placididea
        └─o
          ├─o Developayella
          └─o
            ├─o Slabyrinthulida ou Labyrinthulomycetes
            │ ├─o Labyrinthulidae
            │ ├─o Thraustochytridae
            │ └─o Diplophryidae
            └─o
              ├─o Bicosoecida
              │ ├─o Pirsoniales
              │ └─o Bicosoecales
              │   ├─o Bicosoecaceae
              │   ├─o Cafeteriaceae
              │   └─o Siluaniaceae
              └─o
                ├─o Sloomycetes
                │ ├─o Hyphochytriomycetes ou Hyphochytriales
                │ │ ├─o Hyphochytriaceae
                │ │ └─o Rhizidiomycetaceae
                │ └─o Oomycota
                │   ├─o Haptoglossales
                │   ├─? Lagenaceae
                │   ├─o Ectrogellaceae
                │   ├─o Eurychasmataceae
                │   ├─o Pontismataceae
                │   ├─o Sirolpidiaceae
                │   ├─o Rozellopsidales
                │   │ ├─o Pseudosphaeritaceae
                │   │ └─o Rozellopsidaceae
                │   └─o Oomycetes
                │     ├─? Anisolpidiales
                │     ├─? Lagenismatales
                │     ├─o Sclerosporales
                │     │ ├─o Sclerosporaceae
                │     │ └─o Verrucalvaceae
                │     ├─o Salilagenidiales
                │     │ ├─o Haliphthoraceae
                │     │ └─o Salilagenidiaceae
                │     ├─o Saprolegniales
                │     │ ├─o Leptolegniaceae
                │     │ └─o Saprolegniaceae
                │     ├─o Olpidiopsidales
                │     ├─o Myzocytiopsidales
                │     │ ├─o Crypticolaceae
                │     │ └─o Myzocytiopsidaceae
                │     ├─o Leptomitales
                │     │ ├─o Leptolegniellaceae
                │     │ ├─o Apodachlyellaceae
                │     │ ├─o Ducellieriaceae
                │     │ └─o Leptomitaceae
                │     ├─o Rhipidiales
                │     ├─o Pythiales
                │     │ ├─o Pythiaceae
                │     │ └─o Pythiogetonaceae
                │     └─o Peronosporales
                │       ├─o Peronosporaceae
                │       └─o Albuginaceae
                └─o Stramenochromes ou Ochrophyta
                  ├─o Diatomeae
                  │ ├─o Bolidophyceae ou Bolidomonadales
                  │ └─o Bacillariophyta
                  │   ├─o Bacillariophyceae
                  │   │ ├─o Eunotiophycidae ou Eunotiales
                  │   │ │ ├─o Eunotiaceae
                  │   │ │ └─o Peroniaceae
                  │   │ └─o Bacillariophycidae
                  │   │   ├─o Lyrellales
                  │   │   ├─o Mastogloiales
                  │   │   ├─o Dictyoneidales
                  │   │   ├─o Cymbellales
                  │   │   │ ├─o Rhoicospheniaceae
                  │   │   │ ├─o Anomoeoneidaceae
                  │   │   │ ├─o Cymbellaceae
                  │   │   │ └─o Gomphonemataceae
                  │   │   ├─o Achnanthales
                  │   │   │ ├─o Achnanthaceae
                  │   │   │ ├─o Cocconeidaceae
                  │   │   │ └─o Achnanthidiaceae
                  │   │   ├─o Thalassiophysales
                  │   │   │ ├─o Catenulaceae
                  │   │   │ └─o Thalassiophysaceae
                  │   │   ├─o Bacillariales
                  │   │   ├─o Rhopalodiales
                  │   │   ├─o Surirellales
                  │   │   │ ├─o Entomoneidaceae
                  │   │   │ ├─o Auriculaceae
                  │   │   │ └─o Surirellaceae
                  │   │   └─o Naviculales
                  │   │     ├─o Phaeodactylaceae
                  │   │     ├─o Diploneidaceae
                  │   │     ├─o Naviculineae
                  │   │     │ ├─o Naviculaceae
                  │   │     │ ├─o Pleurosigmataceae
                  │   │     │ ├─o Plagiotropidaceae
                  │   │     │ ├─o Stauroneidaceae
                  │   │     │ └─o Proschkiniaceae
                  │   │     ├─o Sellaphorineae
                  │   │     │ ├─o Sellaphoraceae
                  │   │     │ └─o Pinnulariaceae
                  │   │     └─o Neidiineae
                  │   │       ├─o Berkeleyaceae
                  │   │       ├─o Cavinulaceae
                  │   │       ├─o Cosmioneidaceae
                  │   │       ├─o Scolioneidaceae
                  │   │       ├─o Diadesmidaceae
                  │   │       ├─o Amphipleuraceae
                  │   │       ├─o Brachysiraceae
                  │   │       ├─o Neidiaceae
                  │   │       └─o Scoliotropidacea
                  │   ├─o Fragilariophyceae
                  │   │ ├─o Fragilariales
                  │   │ ├─o Tabellariales
                  │   │ ├─o Licmophorales
                  │   │ ├─o Rhaphoneidales
                  │   │ │ ├─o Rhaphoneidaceae
                  │   │ │ └─o Psammodiscaceae
                  │   │ ├─o Ardissoneales
                  │   │ ├─o Toxariales
                  │   │ ├─o Thalassionematales
                  │   │ ├─o Rhabdonematales
                  │   │ ├─o Striatellales
                  │   │ ├─o Climacospheniales
                  │   │ ├─o Protoraphidales
                  │   │ └─o Cyclophorales
                  │   │   ├─o Cyclophoraceae
                  │   │   └─o Entopylaceae
                  │   └─o Coscinodiscophyceae
                  │     ├─o Thalassiosirophycidae ou Thalassiosirales
                  │     │ ├─o Thalassiosiraceae
                  │     │ ├─o Skeletonemataceae
                  │     │ ├─o Stephanodiscaceae
                  │     │ └─o Lauderiaceae
                  │     ├─o Biddulphiophycidae
                  │     │ ├─o Triceratiales
                  │     │ │ ├─o Triceratiaceae
                  │     │ │ └─o Plagiogrammaceae
                  │     │ ├─o Biddulphiales
                  │     │ ├─o Anaulales
                  │     │ └─o Hemiaulales
                  │     │   ├─o Hemiaulaceae
                  │     │   ├─o Bellerocheaceae
                  │     │   └─o Streptothecaceae
                  │     ├─o Lithodesmiophycidae ou Lithodesmiales
                  │     ├─o Corethrophycidae ou Corethrales
                  │     ├─o Cymatosirophycidae ou Cymatosirales
                  │     │ ├─o Cymatosiraceae
                  │     │ └─o Rutilariaceae
                  │     ├─o Rhizosoleniophycidae ou Rhizosoleniales
                  │     │ ├─o Rhizosoleniaceae
                  │     │ └─o Pyxillaceae
                  │     ├─o Chaetocerotophycidae
                  │     │ ├─? Leptocylindrales
                  │     │ └─o Chaetocerotales
                  │     │   ├─o Chaetocerotaceae
                  │     │   ├─o Acanthocerataceae
                  │     │   └─o Attheyaceae
                  │     └─o Coscinodiscophycidae
                  │       ├─o Chrysanthemodiscales
                  │       ├─o Melosirales
                  │       │ ├─o Melosiraceae
                  │       │ ├─o Stephanopyxidaceae
                  │       │ ├─o Endictyaceae
                  │       │ └─o Hyalodiscaceae
                  │       ├─o Paraliales
                  │       ├─o Aulacoseirales
                  │       ├─o Orthoseirales
                  │       ├─o Ethmodiscales
                  │       ├─o Stictocyclales
                  │       ├─o Asterolamprales
                  │       ├─o Arachnoidiscales
                  │       ├─o Stictodiscales
                  │       └─o Coscinodiscales
                  │         ├─o Coscinodiscaceae
                  │         ├─o Rocellaceae
                  │         ├─o Aulacodiscaceae
                  │         ├─o Gossleriellaceae
                  │         ├─o Hemidiscaceae
                  │         └─o Heliopeltaceae
                  └─o Phaeista
                    ├─o Aurosphaeraceae
                    ├─o Parmales
                    │ ├─o Pentalaminaceae
                    │ └─o Triparmaceae
                    ├─o Hypogyrista
                    │ ├─o Pelagophyceae
                    │ │ ├─o Pelagomonadales
                    │ │ └─o Sarcinochrysidales
                    │ └─o Actinochrysophyceae ou Axodines
                    │   ├─o Dictyochales ou Silicoflagellata
                    │   └─o Abaxodinae ou Abodines
                    │     ├─o Rhizochromulinales
                    │     └─o Actinodinea
                    │       ├─o Ciliophryida
                    │       ├─o Actinophryida
                    │       └─o Pedinellales
                    │         ├─o Pedinellaceae
                    │         └─o Cyrtophoraceae
                    └─o Chrysista
                      ├─o Limnistia
                      │ ├─? Pinguiophyceae
                      │ ├─? Schizocladidae
                      │ ├─o Eustigmatales
                      │ ├─o Raphidomonadales
                      │ │ ├─o Vacuolariaceae
                      │ │ └─o Thaumatomastigaceae
                      │ ├─o Synurales
                      │ │ ├─o Mallomonadaceae
                      │ │ └─o Synuraceae
                      │ ├─o Phaeothamniophyceae
                      │ │ ├─o Phaeothamniales
                      │ │ └─o Pleurochloridellales
                      │ └─o Chrysophyceae
                      │   ├─o Hibberdiales
                      │   │ ├─o Hibberdiaceae
                      │   │ └─o Stylococcaceae
                      │   ├─o Hydrurales
                      │   └─o Chromulinales
                      │     ├─? Stichogloeaceae
                      │     ├─o Chromulinaceae
                      │     ├─o Dinobryaceae ou Ochromonadaceae
                      │     ├─o Paraphysomonadaceae
                      │     ├─o Chrysolepidomonadaceae
                      │     ├─o Chrysamoebaceae
                      │     ├─o Chrysocapsaceae
                      │     ├─o Chrysosphaeraceae
                      │     └─o Chrysothallaceae
                      └─o Phaeistia
                        ├─o Chrysomerophyceae
                        ├─o Xanthophyceae
                        │ ├─o Phyllosiphonaceae
                        │ ├─o Chloramoebales
                        │ ├─o Rhizochloridales
                        │ │ ├─o Rhizochloridaceae
                        │ │ ├─o Stipitococcaceae
                        │ │ └─o Myxochloridaceae
                        │ ├─o Heterogloeales
                        │ │ ├─o Heterogloeaceae
                        │ │ ├─o Mallodendraceae
                        │ │ └─o Characidiopsidaceae
                        │ ├─o Tribonematales
                        │ │ ├─o Neonemataceae
                        │ │ ├─o Tribonemataceae
                        │ │ ├─o Heterodendraceae
                        │ │ └─o Heteropediaceae
                        │ ├─o Vaucheriales
                        │ │ ├─o Botrydiaceae
                        │ │ └─o Vaucheriaceae
                        │ └─o Mischococcales
                        │   ├─o Pleurochloridaceae
                        │   ├─o Botrydiopsidaceae
                        │   ├─o Botryochloridaceae
                        │   ├─o Gloeobotrydaceae
                        │   ├─o Gloeopodiaceae
                        │   ├─o Mischococcaceae
                        │   ├─o Characiopsidaceae
                        │   ├─o Chloropediaceae
                        │   ├─o Trypanochloridaceae
                        │   ├─o Centritractaceae
                        │   ├─o Chlorotheciaceae
                        │   └─o Ophiocytaceae
                        └─o Phaeophyceae
                          ├─o Scytothamniales
                          ├─o Cutleriales
                          ├─o Tilopteridales
                          ├─o Sphacelariales
                          │ ├─o Sphacelariaceae
                          │ ├─o Stypocaulaceae
                          │ ├─o Cladostephaceae
                          │ └─o Choristocarpaceae
                          ├─o Dictyotales
                          │ ├─o Scoresbyellaceae
                          │ └─o Dictyotaceae
                          ├─o Sporochnales
                          ├─o Desmarestiales
                          │ ├─o Desmarestiaceae
                          │ └─o Arthrocladiaceae
                          ├─o Dictyosiphonales
                          │ ├─o Myriotrichiaceae
                          │ ├─o Giraudiaceae
                          │ ├─o Striariaceae
                          │ ├─o Delamareaceae
                          │ ├─o Asperococcaceae
                          │ ├─o Buffhamiaceae
                          │ ├─o Pogotrichiaceae
                          │ ├─o Punctariaceae
                          │ ├─o Chnoosporaceae
                          │ ├─o Coilodesmaceae
                          │ └─o Dictyosiphonaceae
                          ├─o Scytosiphonales
                          ├─o Laminariales
                          │ ├─o Pseudochordaceae
                          │ ├─o Chordaceae
                          │ ├─o Laminariaceae
                          │ ├─o Phyllariaceae
                          │ ├─o Lessoniaceae
                          │ └─o Alariaceae
                          ├─o Fucales
                          │ ├─o Fucaceae
                          │ ├─o Himanthaliaceae
                          │ ├─o Hormosiraceae
                          │ ├─o Phyllosporaceae
                          │ ├─o Sargassaceae
                          │ └─o Cystoseiraceae
                          ├─o Durvillaeales
                          ├─o Ascoseirales
                          ├─o Ectocarpales
                          │ ├─o Adenocystaceae
                          │ ├─o Ectocarpaceae
                          │ ├─o Pilayellaceae
                          │ ├─o Sorocarpaceae
                          │ └─o Lithodermataceae
                          └─o Chordariales
                            ├─o Ralfsiaceae
                            ├─o Myrionemataceae
                            ├─o Elachistaceae
                            ├─o Leathesiaceae
                            ├─o Spermatochnaceae
                            ├─o Acrotrichaceae
                            ├─o Chordariaceae
                            ├─o Ishigeaceae
                            ├─o Chordariopsidaceae
                            ├─o Notheiaceae
                            └─o Splachnidiaceae


Dinobryon sp. (Chrysophyceae d'eau douce)


[modifier] Débat scientifique relatif à la phylogénie des Chromista

[modifier] En savoir plus

[modifier] Sources bibliographiques de référence

[modifier] Autres sources bibliographiques

[modifier] Sources internet

[modifier] Liens internes

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