Sens 5' vers 3'
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Les brins d'ADN et d'ARN sont des polymères formés d'assemblage de nucléotides.
Les quatre différentes sortes de nucléotides comprennent chacune un pentose (sucre à 5 atomes de carbone) : le ribose.
L'assemblage des nucléotides, qui s'effectue à l'aide de ces sucres, est orienté. Une molécule de phosphate relie le carbone 3 du premier sucre, au carbone 5 du sucre suivant, qui lui-même associe son carbone 3, à travers une molécule de phosphate, au carbone 5 du sucre suivant. Et ainsi de suite, de proche en proche.
Cela détermine ainsi une chaîne orientée de nucléotides, ou l'on peut déterminer l'extrémité 3' du brin, et l'extrémité 5', à l'opposé.
Cela permet de déterminer également un sens de déplacement :
- de 3' vers 5'
- de 5' vers 3'
Dans l'ARN, un seul brin est présent, mais dans l'ADN, deux brins sont liés entre-eux par les bases, et les brins sont toujours en sens opposé.
Ainsi, lors de la réplication de l'ADN ou lors de la transcription, le brin 5' - 3' est favorisé :
- lors de l'opération de séparation des brins, le brin 5' - 3' est dupliqué lors de la progression de l'enzyme le long du brin ;
- pour le brin 3' - 5', l'opération est suspendue, et se produit, par fragments (les fragment d'Okazaki), dans le sens 5' - 3' (sens inverse de la progression de l'enzyme).
Amorces utilisées dans un sens.
